Судя по описанию, вполне вероятно, что у вас сейчас сочетаются два процесса — воспаление влагалища и цистит. Эти органы расположены очень близко, и инфекция может распространяться от одного к другому, поэтому подобное сочетание встречается довольно часто. Боль при мочеиспускании, появившаяся отдельно от симптомов вагинита, больше похожа именно на присоединение цистита.
Свечи, назначенные гинекологом, во время месячных действительно ставить не стоит — их лучше отложить до окончания кровотечения, эффект от лечения вагинита в период менструации будет снижен. Растительный уросептик, который вы принимаете, можно продолжать пить и во время месячных, он не противопоказан.
При этом однократного растительного средства для лечения острого цистита обычно недостаточно — чаще требуется короткий курс антибактериального препарата, который подбирается врачом, особенно если боли усиливаются или появляется температура, кровь в моче. Постарайтесь сдать анализ мочи как можно раньше, не дожидаясь конца недели, и при нарастании симптомов — обратиться к врачу очно или в дежурный кабинет, не откладывая до плановой сдачи анализов.