По описанию два жёлтых плотных бугорка на небе, напоминающих зёрнышки, с болезненностью при нажатии могут быть связаны с несколькими причинами — от небольших ретенционных образований малых слюнных желёз до реакции слизистой на раздражение. Точно определить природу образования только по описанию нельзя, нужен очный осмотр.
Я рекомендую обратиться на приём к стоматологу, желательно с профилем пародонтолога, который специализируется на заболеваниях слизистой оболочки полости рта. Врач осмотрит образования, оценит их плотность, цвет, связь с окружающими тканями и решит, требуется ли дополнительное обследование.
Отдельно стоит сделать панорамный снимок зубов, чтобы исключить хронические воспалительные процессы, например периодонтит, которые иногда дают отражённые ощущения в области неба и могут сопровождаться неприятным привкусом во рту. Пока рекомендую не травмировать бугорки и не нажимать на них лишний раз, а с визитом к врачу не затягивать, особенно если появится нарастание боли, отёк или изменение размера образований.